Séminaire recherche reproductible : Reproductibilité de la vision par ordinateur basée sur l'apprentissage machine en bio-imagerie

Le 18 juin 2024

En distanciel

Dans le cadre des séminaires “Pour une Recherche Reproductible”, le réseau Recherche reproductible, Gricad, MaiMoSiNE et SARI vous proposent le prochain webinaire animé par David Rousseau, enseignant-chercheur à l'Université d'Angers où il pilote une équipe en vision par ordinateur appliquée en imagerie du vivant.
Toutes les informations sur ce séminaire sont disponibles sur le site du Réseau Grenoblois autour de la Recherche Reproductible.

Café Guix - "Les commandes guix time-machine et guix describe"

Le 28 mai de 13h à 14h

En distanciel

Cette session sera animée par Marek Felšöci, post-doctorant à l'INRIA et ICUBE, sur ce lien de connexion.

Dans Guix, les paquets logiciels, y compris Guix lui-même, sont mis à disposition à travers de ce que l'on appelle les canaux. Au fil du temps, l'offre de paquets dans ces canaux évolue. Les versions changent, de nouveaux paquets ou de nouvelles fonctionnalités Guix apparaissent, d'autres disparaissent. Par exemple, en 2021, il était possible de demander à Guix de créer un environnement logiciel avec le paquet Inkscape en version 0.92 en utilisant la commande =guix environment --pure --ad-hoc inkscape@0.92=. En 2024, le canal concerné ne propose plus la version 0.92 d'Inkscape et la commande =guix environment= a cédé sa place à la nouvelle commande =guix shell=.
Pour pouvoir réutiliser la ligne de commande et retrouver l'environnement logiciel d'origine, il nous faudrait retourner dans le passé. Impossible ? Pas pour Guix ! A l'occasion du prochain Café Guix, nous verrons comment utiliser sa machine à voyager dans le temps, la commande =guix time-machine=. Les canaux, qui sont en fait des dépôts git versionnés, permettent de garder la trace de leurs évolutions. A condition de disposer de la liste des canaux et de leurs numéros de révisions (commits) respectifs de l'époque, avec =guix time-machine=, il est alors possible de retourner exactement au bon moment en 2021. Bien qu'il soit possible d'approximer le bon repère temporel a posteriori, il est préférable d'en garder la trace depuis le début. Dans ce contexte, nous découvrirons également la commande =guix describe=.

Pour rappel, le Café Guix est un lieu et un temps d'échange informel et francophone autour du gestionnaire d'environnement logiciel Guix. Étudiant-e-s, chercheuses et chercheurs, admin. système, IT support de labos ou de centre de calcul, tout le monde est le bienvenu dans ce rendez-vous mensuel d'une heure où l'on discutera de questionnements apportés par chacun sur Guix et sa pratique au sens large.
Vous trouverez toutes les infos concernant les Cafés Guix par ici (ainsi que l’adresse d’un mattermost dédié) : https://hpc.guix.info/events/2024/café-guix/.

Transparency to Sustain Open Science Infrastructure

“Transparency to Sustain Open Science Infrastructure” est un nouveau projet porté par l'Université Grenoble Alpes et mis en oeuvre par l'unité GRICAD.
Il s’inscrit dans le contexte de la soutenabilité des infrastructures de la science ouverte (par exemple DOAJ, DataCite, OpenCitation, SoftwareHeritage, Dataverse, Research Organization Registry et bien d'autres).
Lire la suite...

MESONET

MesoNET a pour objet de répondre aux besoins des chercheurs et enseignants universitaires et industriels avec le développement d'équipements numériques structurants. L'idée principale est de renforcer la structuration des offres nationales et régionales en simulation numérique, le calcul haute performance (HPC), associé aux méthodes d'intelligence artificielle (IA) avec également un accès à une QLM et à des formations sur le calcul quantique. L'objectif premier est de mettre en place une infrastructure régionale distribuée, en intégrant au moins un mésocentre par région, institués comme références et relais régionaux. L'infrastructure, intégrée à l'initiative European Open Science Cloud (EOSC), devrait avoir un impact significatif sur l'appropriation par les chercheurs des infrastructures numériques et IA publiques nationales et régionales.
Les objectifs du projet sont disponibles ici.
Regarder la vidéo de présentation.
Pour MesoNET, GRICAD va acquérir et opérer la plateforme Openstack (Cloud Computing). La contribution de GRICAD à MesoNET est portée par l’Université Grenoble Alpes.

Café Guix - "Introduction aux G-exp"

Le 30 avril 2024 de 13h à 14h

En distanciel

Cette session sera animée par Simon Tournier, ingénieur de recherche à l'Université de Paris Cité sur ce lien de connexion.
Après la lecture de la section [« Définition des paquets »], et après quelques itérations test/erreur, nous devons ici ou là mettre des symboles #~(#$(%. Ce Café Guix essaiera de les rendre moins cryptiques. Nous introduirons quelques ingrédients de la boite à outils Scheme/Guile (quote, quasiquote, unquote) ce qui nous mènera aux G-expressions.

Pour rappel, le Café Guix est un lieu et un temps d'échange informel et francophone autour du gestionnaire d'environnement logiciel Guix. Étudiant-e-s, chercheuses et chercheurs, admin. système, IT support de labos ou de centre de calcul, tout le monde est le bienvenu dans ce rendez-vous mensuel d'une heure où l'on discutera de questionnements apportés par chacun sur Guix et sa pratique au sens large.
Vous trouverez toutes les infos concernant les Cafés Guix par ici (ainsi que l’adresse d’un mattermost dédié) : https://hpc.guix.info/events/2024/café-guix/.